Αμέσως μετά την ίδρυση της Εταιρείας Μακεδονικών Σπουδών, τον Απρίλιο του 1939, πρώτο μέλημα του Διοικητικού Συμβουλίου της, ήταν να εκδώσει, με τη
συνεργασία επιφανών επιστημόνων εταίρων το ετήσιο περιοδικό σύγγραμμα υπό τον τίτλο Μακεδονικά. Ο πρώτος τόμος εκδόθηκε στα τέλη του 1940, με επιμέλεια του
πρώτου Προέδρου της Εταιρείας, καθηγητή στη Φιλοσοφική Σχολή του Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης, Αντωνίου Σιγάλα, υπό τους ήχους των τηλεβόλων και
αφιερώθηκε «Εις τους ηρωικώς υπέρ της ελευθερίας αγωνιζομένους Έλληνες», οι οποίοι είχαν ανατρέψει τους Ιταλούς επιδρομείς προελαύνοντας
ακάθεκτοι στη Βόρειο Ήπειρο.
Ο πρώτος τόμος των Μακεδονικών κυκλοφόρησε κανονικά καθ’ όλο το διάστημα, του Ελληνοϊταλικού πολέμου, όχι μόνο στη Μακεδονία, αλλά και στην υπόλοιπη
Αμέσως μετά την ίδρυση της Εταιρείας Μακεδονικών Σπουδών, τον Απρίλιο του 1939, πρώτο μέλημα του Διοικητικού Συμβουλίου της, ήταν να εκδώσει, με τη συνεργασία επιφανών επιστημόνων εταίρων το ετήσιο περιοδικό σύγγραμμα υπό τον τίτλο Μακεδονικά. Ο πρώτος τόμος εκδόθηκε στα τέλη του 1940, με επιμέλεια του πρώτου Προέδρου της Εταιρείας, καθηγητή στη Φιλοσοφική Σχολή του Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης, Αντωνίου Σιγάλα, υπό τους ήχους των τηλεβόλων και αφιερώθηκε «Εις τους ηρωικώς υπέρ της ελευθερίας αγωνιζομένους Έλληνες», οι οποίοι είχαν ανατρέψει τους Ιταλούς επιδρομείς προελαύνοντας ακάθεκτοι στη Βόρειο Ήπειρο.
Ο πρώτος τόμος των Μακεδονικών κυκλοφόρησε κανονικά καθ’ όλο το διάστημα, του Ελληνοϊταλικού πολέμου, όχι μόνο στη Μακεδονία, αλλά και στην υπόλοιπη Ελλάδα. Όταν όμως, τα γερμανικά στρατεύματα κατέλαβαν την Θεσσαλονίκη απαίτησαν ν’ απαλειφθούν από τον τόμο τα θίγοντα τον σύμμαχό του «Προλεγόμενα», καθώς και η αφιέρωση προς τους αγωνιζόμενους Έλληνες.
Το Διοικητικό Συμβούλιο της Εταιρείας αρνήθηκε να υπακούσει στην αυθαίρετη αξίωση του Κατακτητή, και αντιμετώπισε τις σχετικές συνέπειες: Διετάχθη αμέσως η κατάσχεση και καταστροφή των ευρισκομένων αντιτύπων των «Μακεδονικών» στα βιβλιοπωλεία, απαγορεύθηκε η κυκλοφορία του, κατασχέθηκε το Αρχείο και τα Πρακτικά των συνεδριάσεων του Διοικητικού Συμβουλίου της Εταιρείας, τα οποία φυλάσσονταν (ελλείψει στέγης) στην κατοικία του Γενικού Γραμματέα του, Αλεξάνδρου Λέτσα και διετάχθη η σύλληψη και φυλάκιση αυτού για ένα τρίμηνο.
Τα Μακεδονικά κυκλοφορούν κανονικά μέχρι σήμερα, που βρίσκονται στον 39ο τόμο τους ο οποίος θα κυκλοφορήσει σύντομα και διευθύνονται από Συντακτική Επιτροπή αποτελούμενη από εταίρους της ΕΜΣ.
Τα πλούσια περιεχόμενά του περιέχουν μελέτες ιστορικού, αρχαιολογικού, λαογραφικού ή άλλου χαρακτήρα οι οποίες αναφέρονται αποκλειστικά στον Βόρειο Ελληνικό χώρο, στη Μακεδονία και τη Θράκη, και κυκλοφορούν στην Ελλάδα και το εξωτερικό μέσα από ένα ευρύ δίκτυο συνδρομητών, ανταλλαγών και πωλήσεων.